由寇克（威廉·夏特纳 饰）将军领导的“企业号”太空船，因为接收到来自太阳系的不明探测波，征求组员同意后展开了一段回到过去的时光旅行。企业号太空船上的成员，为了拯救地球的未来，由23世纪回到20世纪。因为一艘外星太空船威胁要毁灭地球，除非他们能与座头鲸说话，但是，座头鲸早在数百年前就绝种了！所以，寇克船长只好带着船员们回到1986年，再度担负起拯救人类的使命，从在旧金山营救了两条全世界硕果仅存的座头鲸并带入未来，拯救地球！...