地球进入了创世纪的0011年，人类却失去了2/3的人口，究其原因，还是因为11年前的那场大异变------南极的冰水融化了，被认为在1万2千年前就应该灭亡的阿托兰迪亚又得到复苏，被称为有着双翼的堕天翅族。他们向人类居住的城市不断地派出生物机械兵器神话兽去捕获人类，为的就是获取一种名为普拉纳的生物体能量。 另一方面，人类也在策划着反击，他们从海底遗迹中发掘出3架混合战斗机Vector Machine。它们是在1万2千年前将堕天翅族灭亡的传说中的兵器。只要3架战斗机合体的话，就将变成威力强大的机械天使阿克艾里欧。 要想驾驭阿克艾里欧。就必须要求驾驶员拥有能够与机械生命产生感应，共鸣的特殊元素，也就是特殊体制的人类。而且因为要求有特别敏锐的五感和纯净的灵魂，于是召集了翼披只有10来岁左右的少男少女来作为飞行员的人选。 终于，机械天使阿克艾里欧合体的时刻来到了……...